Die Aufgaben und Zuständigkeiten des Kommissionspräsidenten liegen darin die politische Leitlinie für das Vorgehen der Kommission zu bestimmen. Darüber hinaus organisiert er die Arbeit der Kommission und beruft die Sitzungen des Kollegiums ein welche er leitet.

Des weiteren vertritt der Präsident die Kommission bei den Tagungen des Europäischen Rates, der Gruppe der acht führenden Indistrienationen (G8) sowie bei den Sitzungen des Europäischen Parlaments.

Das heutige Amt des Präsident der Europäischen Kommission geht letztlich auf das Amt des Präsidenten der Hohen Behörde der Europäischen Gemeinschaft für Kohle und Stahl (EGKS) zurück, das es seit 1952 gibt. Von Anfang an wurde die Hohe Behörde auch schon als "Kommission" genannt. 1958 entstand neben der EGKS und der europäischen Atomgemeinschaft die Europäische Wirtschaftsgemeinschaft (EWG), die aber in gewissem Sinne eine Weiterentwicklung und sehr große Vertiefung der EGKS darstellte. Bis 1967 bestand die EGKS noch selbständig weiter, bis die drei Gemeinschaften schließlich fusionierten. Dabei war die EWG schon zur ganz entscheidenden der drei Gemeinschaften geworden. Eine wirkliche Kontinuität des Amtes besteht darum eigentlich erst seit 1958.

Fast jeder Wahl eines Kommissionspräsidenten geht ein langes Tauziehen zwischen Regierungschefs und Parlament, sowie den großen regionalen und politischen Blöcken (Sozialdemokraten, EVP) voraus.

Der Rat der Staats- und Regierungschefs bevorzugt einen Mann aus seiner Mitte, doch in dem Gegensatz zu dem Europaparlament nicht unbedingt eine "starke" Persönlichkeit. 2004 war der Ablauf zur Bestellung des Nachfolgers von Romano Prodi besonders interessant, weil wichtige, SP-geführte Regierungen (z.B. Gerhard Schröder) einer deutlichen EVP-Parlamentsmehrheit gegenüberstanden.
Unter den chancenreichen Kandidaten (u. a. Jan Peter Balkenende (Niederlande), José Barroso (Portugal), Jean-Claude Juncker (Luxemburg), der jedoch absagte, Wolfgang Schüssel (Österreich), Guy Verhofstadt (Belgien), EU-Außenbeauftragter Javier Solana und Außenkommissar Chris Patten) wurde erst Ende Juni eine engere Auswahl getroffen, bei der schließlich Barroso die größte Zustimmung fand (siehe Kommissionspräsident, Suche 2004.

Präsidenten der Hohen Behörde , seit Anbeginn auch schon als "Kommission" der Europäischen Gemeinschaft für Kohle und Stahl genannt:

• 1952-1955 Jean Monnet
• 1955-1958 René Mayer
• 1958-1959 Paul Finet
• 1959-1963 Piero Malvestiti
• 1963-1967 Dino Del Bo

Präsidenten der Kommission der EWG (1958-1967), EG (1967-1993) und EU (seit 1993)

• Website des Kommissionspräsidenten Romano Prodi: http://europa.eu.int/comm/commissioners/prodi/index_de.htm
• Website der Europäischen Kommission: http://europa.eu.int/comm/index_de.htm